ASTR-0123
Run Name
28 + 90
Lane 1 (R1 + R2)
28 + 90
Lane 2 (R1 + R2)
1,495,358,590
Polonies
95.8%
Q30
93.2%
Index Assignment
164.398
Assigned Yield (Gb)
10 + 10
Lane 1 (I1 + I2)
10 + 10
Lane 2 (I1 + I2)
0.00%
Unexpected Pairs
Index Percentiles
Percentile Sample I1 I2 Polonies % Polonies
5th SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 1,394,241,564 93.2379
50th SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 1,394,241,564 93.2379
95th SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 1,394,241,564 93.2379
All Indices
# Sample I1 I2 Polonies % Polonies
1 SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 1,394,241,564 93.2379
Top Unassigned Sequences
# I1 I2 Polonies % Polonies
1 GTGACATGCA ATGGTCTAAA 9,348,702 0.6252
2 CTGACATGCA ATGGTCTAAA 6,452,783 0.4315
3 CGTACATGCA ATGGTCTAAA 5,185,837 0.3468
4 CGTGACATCA ATGGTCTAAA 4,768,187 0.3189
5 CGGACATGCA ATGGTCTAAA 4,535,604 0.3033
6 CGTGACTGCA ATGGTCTAAA 3,078,833 0.2059
7 CGTGACATGC ATGGTTAAAA 2,903,625 0.1942
8 CGTGACAGCA ATGGTCTAAA 2,693,745 0.1801
9 CGTGCATGCA ATGGTCTAAA 2,248,046 0.1503
10 CGTGAATGCA ATGGTCTAAA 2,065,170 0.1381
11 CGTGACATGC ATGTCTAAAA 740,995 0.0496
12 CGTGACATGC TGGTCTAAAA 705,257 0.0472
13 CGTGACATGC ATGGCTAAAA 458,430 0.0307
14 CGTGACATGC AGGTCTAAAA 432,408 0.0289
15 CGTGACATGC ATGGGTCTAA 361,577 0.0242
16 CGTGACATGC ATGGTCTCAC 251,761 0.0168
17 CGTGACATGC AATGGTCTAA 195,198 0.0131
18 TTGACATGCA ATGGTCTAAA 188,192 0.0126
19 CGTGACCTTC ATGGTCTAAA 187,027 0.0125
20 CGTGACATGC ATGGTCTCCA 184,941 0.0124
21 CCGTGACATG ATGGTCTAAA 180,142 0.0120
22 CGTGACATGC CTGGTCTCAA 174,116 0.0116
23 CGTGCCCTGC ATGGTCTAAA 171,898 0.0115
24 CGTGACATGC ATGGTCTACC 142,873 0.0096
25 CGACATGCAT ATGGTCTAAA 142,393 0.0095
26 CGTGACATGC ATGGGCTCAA 121,903 0.0082
27 CGTTGACATG ATGGTCTAAA 114,454 0.0077
28 CGTGACATTG ATGGTCTAAA 106,139 0.0071
29 CGTAACATCC ATGGTCTAAA 80,681 0.0054
30 CGTGACATGC CTGGTCTAAC 77,868 0.0052
31 CGTGACTTCC ATGGTCTAAA 66,069 0.0044
32 CGTGACATGC CTGGTCTACA 64,103 0.0043
41.5
Mean Q
96.2%
Q30
84.3%
Q40
3,575
Reads eliminated
28.0
Mean read length
Paired-End
Trim type
16
Min read length