ASTR-0125
Run Name
28 + 90
Lane 1 (R1 + R2)
28 + 90
Lane 2 (R1 + R2)
967,508,069
Polonies
94.3%
Q30
95.8%
Index Assignment
109.268
Assigned Yield (Gb)
10 + 10
Lane 1 (I1 + I2)
10 + 10
Lane 2 (I1 + I2)
0.00%
Unexpected Pairs
Index Percentiles
Percentile Sample I1 I2 Polonies % Polonies
5th SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 926,663,871 95.7784
50th SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 926,663,871 95.7784
95th SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 926,663,871 95.7784
All Indices
# Sample I1 I2 Polonies % Polonies
1 SI-TT-A10 CGTGACATGC ATGGTCTAAA 926,663,871 95.7784
Top Unassigned Sequences
# I1 I2 Polonies % Polonies
1 GTGACATGCA ATGGTCTAAA 4,552,242 0.4705
2 CTGACATGCA ATGGTCTAAA 3,728,959 0.3854
3 CGTGACATCA ATGGTCTAAA 3,051,135 0.3154
4 CGTACATGCA ATGGTCTAAA 2,887,853 0.2985
5 CGGACATGCA ATGGTCTAAA 2,767,300 0.2860
6 CGTGACTGCA ATGGTCTAAA 2,008,167 0.2076
7 CGTGACATGC ATGGTTAAAA 1,879,237 0.1942
8 CGTGACAGCA ATGGTCTAAA 1,740,285 0.1799
9 CGTGCATGCA ATGGTCTAAA 1,458,424 0.1507
10 CGTGAATGCA ATGGTCTAAA 1,325,897 0.1370
11 CGTACATGCC ATGGTCTAAA 584,281 0.0604
12 CGTGACATGC ATGTCTAAAA 463,646 0.0479
13 GTGACCTGCA ATGGTCTAAA 333,120 0.0344
14 CTGACATGCC ATGGTCTAAA 320,558 0.0331
15 CGTGACATGC ATGGCTAAAA 293,868 0.0304
16 CTGACCTGCC ATGGTCTAAA 284,959 0.0295
17 CGTGACATGC TGGTCTAAAA 280,606 0.0290
18 CGTGACATGC AGGTCTAAAA 241,782 0.0250
19 CGGACATGCC ATGGTCTAAA 238,561 0.0247
20 CGTGACATGC ATGGGTCTAA 229,324 0.0237
21 CTGACCTTCC ATGGTCTAAA 227,836 0.0235
22 CTGACCTGCA ATGGTCTAAA 209,254 0.0216
23 CTTACCTTCC ATGGTCTAAA 166,075 0.0172
24 GTGACCTGCC ATGGTCTAAA 165,935 0.0172
25 CGTGACAGCC ATGGTCTAAA 148,137 0.0153
26 GTGACATGCC ATGGTCTAAA 137,923 0.0143
27 CGTGACATGC AATGGTCTAA 127,025 0.0131
28 CCGTGACATG ATGGTCTAAA 93,413 0.0097
29 CGACATGCAT ATGGTCTAAA 93,117 0.0096
30 CGTAACTTCC ATGGTCTAAA 60,010 0.0062
31 CGTGACCTCC ATGGTCTAAA 25,174 0.0026
40.8
Mean Q
94.2%
Q30
78.9%
Q40
3,169
Reads eliminated
28.0
Mean read length
Paired-End
Trim type
16
Min read length